可以的。

1、毕业生的报到证对应个人档案和行政关系，户口迁移证对应本人的户口；对于户口限制比较严格的包括上海在内的几个直辖市，对用人单位招聘优秀毕业生工作又解决不了本市户口的情况，采用的就是户口和档案分离的办法。所以，报到证改派到上海是完全可以的。

2、具体到上海，像你这样的外地生源因工作单位需要暂时居住的高校毕业生：可以通过办理《居住证》进直辖市就业，对这类毕业生的个人档案处理办法如下：（1）如果本市用人单位确实因为工作需要，委托市高校毕业生就业指导中心管理该类毕业生档案的，用人单位在与中心确认委托手续后，可以通知学校将毕业生档案转移至中心；（2）若用人单位不需要委托管理毕业生档案，由学校按照规定将档案转至生源所在地。

从你介绍的情况看，你们单位属于第一种情况，与中心有委托手续。

3、区别在于：档案能不能够跟随你走，这很重要，否则以后你的转正定级手续等等，都要回原籍去办理了。

供你参考。

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